behoren tot de grootste en indrukwekkendste catacomben van heel Rome.Zij ontstonden in het midden van de tweede eeuw en vormen een uitgestrekte begraafplaats van bijna 15 hectaren, in een netwerk van gangen bij benadering 20 km. lang. Op sommige plaatsen hebben deze catacomben 4 verdiepingen en een diepte van meer dan 20 meter.
Tientallen martelaren, 16 pausen en zeer veel christenen vonden hier een graf.

Deze catacomben werden genoemd naar de diaken Callixtus die in het begin van de derde eeuw door paus Zephyrinus aangesteld werd als beheerder van dit ondergronds kerkhof. Zo zijn de catacomben van Sint-Callixtus de eerste officiele begraafplaats van de kerk in Rome.

Aan de oppervlakte bevinden zich twee kleine basilieken "Trichorae" genoemd. In de oosterse tricora werden waarschijnlijk paus Zephyrinus en Tarcisius, de jonge martelaar van de eucharistie, begraven.

Het ondergronds kerkhof bevat verschillende gebieden. De cryptes van Lucina, van de pausen en van de heilige Cecilia zijn de oudste (tweede eeuw). De andere gebieden worden bepaald met de namen van Miltiades (eerste helft van de derde eeuw), Gajus en Eusebius (einde van de derde eeuw). Er is nog een westelijk gebied (eerste deel van de vierde eeuw) en het gebied van Liberius (tweede helft van de vierde eeuw).